O departamento científico de Gestão de ecossistemas do CETAC visa:

• Desenvolver investigação aplicada na área da Ecologia Tropical tendo em vista a utilização racional dos seus recursos hídricos , pedológicos e climáticos;
• lmplementar projectos, estudos e investigação na área do zoneamento ecológico tendo em vista o apoio a implementação de políticas de desenvolvimento sustentável;
• Avaliar o potêncial ecológico dos ecossistemas e implementar projectos de recuperação de ecossistemas degradados;
• Desenvolver investigação aplicada e estudos de gestão de ecossistemas tendo em vista a sua adaptação às Alterações Climáticas.